Frankie Paige, une jeune femme sans histoire, est frappée par les stigmates de Jésus Christ. Le père Andrew Kiernan, un prêtre scientifique, la soutient malgré les réticences du Vatican, qui connait le secret de Frankie.
Alors que ses stigmates s'aggravent, Frankie va devoir affronter, avec Andrew, la peur et la vérité.