Philip a trouvé un complexe souterrain sous la mine, construit pour explorer un tombeau, mais libérant ainsi une entité lâchant un virus qui transforme les êtres vivant en mutants agressifs. Philip se retrouve contaminé et développe une sorte de schizophrénie...
Deuxième épisode d'une trilogie composé de Penumbra : Overture et Penumbra : Requiem

Philip reçoit une lettre de son père, Howard, disparu depuis des années. Il lui demande de détruire un livre en sa possession. En l'examinant, il découvre l'emplacement d'une mine au Groenland. Par curiosité, un an plus tard, il décide d'aller voir ce lieu étrange et de retrouver son père. Une fois arrivé, il découvre que la mine est désertée, laissé sans vie à l'exception de chien agressifs et d'araignées géantes.
Premier épisode d'une trilogie composé de Penumbra : Black Plague et Penumbra : Requiem